John Presper Eckert adalah lulusan Universitas Pennsylvania. Dia menjadi peneliti di Universitas Pennsylvania ketika dia memulai bekerja dengan John W Muchly untuk projek ENIAC (Electronic Numerical Integrator and Computer) pada tahun 1943. ketika dia telah barhasil menyelesaikan ENIAC pada tahun 1946, ENIAC memiliki lebih dari 500.000 sambungan solder menggunakan hantaman kartu untuk menyimpan data. ENIAC digunakan oleh tentara U.S sebagai perhitungan militer.
Pada tahun 1946 Eckert dan Mauchly memulai bisnis bersama yang diberinama Eckert-Mauchly Computer Corporation, pada tahun 1949 Ecker dan Maurchly memperkenalkan BINAC (Binary Automatic Computer) yang menggunakan pita magnetic sebagai tempat penyimpanan data programming theoretical.
Di tahun 1950, Perusahaan Remington Rand mengakuisisi Perusahaan Eckert-Mauchly dan kemudian menggantinya dengan nama Univac Division of Remington Rand yang kemudian menghasilkan sebuah analisa dengan nama UNIVAC1 (Universal Automatic Computer), sebuah komputer yang mengandung beberapa elemen yang sama dengan elemen komputer saat ini.
Pada tahun 1955, Remington Rand muncul dengan perusahaan Sperry untuk membentuk perusahaan Sperry Rand. Eckert tetap bergabung dengan perusahaan tersebut dan menjadi Executive di dalamnya. Dia melanjutkan dengan perusahaan Burroughs yang menjadi Unisys. Pada tahun 1989 Eckert berhenti pada dari Unisys tetapi dia tetap melanjutkan perannya sebagai konsultan perusahaan.
Diantara tahun 1949 dan 1966 Eckert mengambil hak paten atas 85 penemuan, hampir semuanya di bidang elektronik. Dia menerima beberapa penghargaan atas penemuan-penemuannya di bidang komputer, Penghargaan yang mungkin dirasa paling bergengsi adalah penghargaan US National Medal of Science yang di dapat pada tahun 1969. selain itu baik Eckert atau Mauchly mendapatkan penghargaan IEEE Computer Society Pioneer pada tahun 1980.
Eckert meninggal pada tahun 1995 dikarenakan Leukemia di Bryn Mawr, Pennsylvania, USA.